La protéine 35 et l'ARN du virus EbolaPhotothèque scientifique -- Alamy Stock Photo
De nouvelles recherches suggèrent que la combinaison des approches génomique et épidémiologique peut améliorer la réponse de la santé publique aux maladies infectieuses émergentes graves, comme Ebola.
Après la dixième épidémie de virus Ebola en République démocratique du Congo (RDC) en août 2018, l'Institut national de recherche biomédicale (INRB) a acquis la capacité de séquençage génomique et a commencé à collecter et à séquencer des échantillons. Un système de surveillance génomique de bout en bout, incluant le lien entre les résultats et les agents de santé publique de première ligne, a été intégré à la réponse épidémiologique du pays.
Eddy Kinganda-Lusamaki et ses collègues de l'INRB, du Sénégal, de la France et des États-Unis ont analysé 744 génomes, représentant près de 24 % des infections confirmées dans le pays pendant l'épidémie, et ont publié leurs conclusions dans Nature Medicine.
Alors que les précédentes épidémies d'Ebola étaient plus importantes que celle de la région du Nord-Kivu étudiée par l'équipe, le séquençage a été effectué principalement à l'Ouest. Cette étude est la première dans laquelle la majorité du travail est effectuée en RDC.
Ce travail fournit un contexte important pour les agents de santé de première ligne, qui peuvent ainsi obtenir des informations spécifiques et exploitables en temps réel. Les données de la surveillance génomique ont aidé à prendre des décisions cruciales, comme le choix des personnes qui ont reçu les doses limitées de vaccin contre Ebola, en facilitant l'identification des facteurs de super propagation - les funérailles d'un pasteur et un conducteur de taxi-moto infecté - ce qui a permis d'inclure le clergé et les coursiers comme groupes prioritaires pour la vaccination. Elle montre également l'intérêt de renforcer les capacités au niveau local plutôt que de dépendre de recherches effectuées ailleurs.
Cette approche peut également apporter un soutien indispensable pour comprendre et répondre à la pandémie de SRAS-CoV-2 en RDC et dans d'autres pays.
