Table 4 EF1%, BEDROC (α = 160.9), BEDROC (α = 20), AUC, RIE values for snapshots of the apo-SrtA crystal structure MD simulations.

From: Exploration of multiple Sortase A protein conformations in virtual screening

MD snapshot (ns) EF1% BEDROC (a = 160.9) BEDROC (a = 20.0) AUC RIE
0 10 0.152 0.181 0.63 2.99
5 10 0.291 0.289 0.75 4.77
10 0 0.043 0.1 0.58 1.65
20 10 0.209 0.231 0.78 3.82
25 0 0 0.004 0.41 0.07
30 0 0 0.003 0.42 0.05
40 0 0 0.064 0.52 1.06
70 0 0.009 0.1 0.64 1.66
90 0 0 0.06 0.5 0.99
100 0 0.004 0.122 0.63 2.01
110 0 0.01 0.147 0.48 2.42
120 0 0 0.059 0.54 0.97
130 0 0 0.046 0.49 0.76
140 0 0.009 0.091 0.42 1.51
150 10 0.206 0.181 0.69 3
160 0 0.032 0.284 0.73 4.7
170 0 0 0.103 0.58 1.7
180 0 0.024 0.186 0.54 3.07
190 0 0 0.005 0.54 0.09
200 0 0 0.062 0.53 1.02
Average 2 0.049 0.116 0.57 1.92