
Provider: Nature Publishing Group
Content: application/x-research-info-systems
TY  - JOUR
AU  - Surani, M. A.
AU  - Hayashi, K.
AU  - Hajkova, P.
TI  - Genetic and epigenetic regulators of pluripotency
JA  - Cell
PY  - 2007///
VL  - 128
SP  - 747
EP  - 762
M3  - 10.1016/j.cell.2007.02.010
N1  - 10.1016/j.cell.2007.02.010
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2007.02.010
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Bernstein, B. E.
AU  - Meissner, A.
AU  - Lander, E. S.
TI  - The mammalian epigenome
JA  - Cell
PY  - 2007///
VL  - 128
SP  - 669
EP  - 681
M3  - 10.1016/j.cell.2007.01.033
N1  - 10.1016/j.cell.2007.01.033
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2007.01.033
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Kouzarides, T.
TI  - Chromatin modifications and their function
JA  - Cell
PY  - 2007///
VL  - 128
SP  - 693
EP  - 705
M3  - 10.1016/j.cell.2007.02.005
N1  - 10.1016/j.cell.2007.02.005
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2007.02.005
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Buck, M. J.
AU  - Lieb, J. D.
TI  - ChIP-chip: considerations for the design, analysis, and application of genome-wide chromatin immunoprecipitation experiments
JA  - Genomics
PY  - 2004///
VL  - 83
SP  - 349
EP  - 360
M3  - 10.1016/j.ygeno.2003.11.004
N1  - 10.1016/j.ygeno.2003.11.004
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.ygeno.2003.11.004
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Mockler, T. C.
TI  - Applications of DNA tiling arrays for whole-genome analysis
JA  - Genomics
PY  - 2005///
VL  - 85
SP  - 1
EP  - 15
M3  - 10.1016/j.ygeno.2004.10.005
N1  - 10.1016/j.ygeno.2004.10.005
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.ygeno.2004.10.005
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Roh, T. Y.
AU  - Cuddapah, S.
AU  - Zhao, K.
TI  - Active chromatin domains are defined by acetylation islands revealed by genome-wide mapping
JA  - Genes Dev.
PY  - 2005///
VL  - 19
SP  - 542
EP  - 552
M3  - 10.1101/gad.1272505
N1  - 10.1101/gad.1272505
UR  - http://dx.doi.org/10.1101/gad.1272505
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Service, R. F.
TI  - Gene sequencing. The race for the $1000 genome
JA  - Science
PY  - 2006///
VL  - 311
SP  - 1544
EP  - 1546
M3  - 10.1126/science.311.5767.1544
N1  - 10.1126/science.311.5767.1544
UR  - http://dx.doi.org/10.1126/science.311.5767.1544
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Conti, L.
TI  - Niche-independent symmetrical self-renewal of a mammalian tissue stem cell
JA  - PLoS Biol.
PY  - 2005///
VL  - 3
SP  - e283
M3  - 10.1371/journal.pbio.0030283
N1  - 10.1371/journal.pbio.0030283
UR  - http://dx.doi.org/10.1371/journal.pbio.0030283
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Bernstein, B. E.
TI  - A bivalent chromatin structure marks key developmental genes in embryonic stem cells
JA  - Cell
PY  - 2006///
VL  - 125
SP  - 315
EP  - 326
M3  - 10.1016/j.cell.2006.02.041
N1  - 10.1016/j.cell.2006.02.041
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2006.02.041
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Ringrose, L.
AU  - Paro, R.
TI  - Epigenetic regulation of cellular memory by the Polycomb and Trithorax group proteins
JA  - Annu. Rev. Genet.
PY  - 2004///
VL  - 38
SP  - 413
EP  - 443
M3  - 10.1146/annurev.genet.38.072902.091907
N1  - 10.1146/annurev.genet.38.072902.091907
UR  - http://dx.doi.org/10.1146/annurev.genet.38.072902.091907
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Schuettengruber, B.
AU  - Chourrout, D.
AU  - Vervoort, M.
AU  - Leblanc, B.
AU  - Cavalli, G.
TI  - Genome regulation by polycomb and trithorax proteins
JA  - Cell
PY  - 2007///
VL  - 128
SP  - 735
EP  - 745
M3  - 10.1016/j.cell.2007.02.009
N1  - 10.1016/j.cell.2007.02.009
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2007.02.009
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Azuara, V.
TI  - Chromatin signatures of pluripotent cell lines
JA  - Nature Cell Biol.
PY  - 2006///
VL  - 8
SP  - 532
EP  - 538
M3  - 10.1038/ncb1403
N1  - 10.1038/ncb1403
UR  - http://dx.doi.org/10.1038/ncb1403
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Saxonov, S.
AU  - Berg, P.
AU  - Brutlag, D. L.
TI  - A genome-wide analysis of CpG dinucleotides in the human genome distinguishes two distinct classes of promoters
JA  - Proc. Natl Acad. Sci. USA
PY  - 2006///
VL  - 103
SP  - 1412
EP  - 1417
M3  - 10.1073/pnas.0510310103
N1  - 10.1073/pnas.0510310103
UR  - http://dx.doi.org/10.1073/pnas.0510310103
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Weber, M.
TI  - Distribution, silencing potential and evolutionary impact of promoter DNA methylation in the human genome
JA  - Nature Genet.
PY  - 2007///
VL  - 39
SP  - 457
EP  - 466
M3  - 10.1038/ng1990
N1  - 10.1038/ng1990
UR  - http://dx.doi.org/10.1038/ng1990
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Bernstein, B. E.
TI  - Genomic maps and comparative analysis of histone modifications in human and mouse
JA  - Cell
PY  - 2005///
VL  - 120
SP  - 169
EP  - 181
M3  - 10.1016/j.cell.2005.01.001
N1  - 10.1016/j.cell.2005.01.001
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2005.01.001
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Kim, T. H.
TI  - A high-resolution map of active promoters in the human genome
JA  - Nature
PY  - 2005///
VL  - 436
SP  - 876
EP  - 880
M3  - 10.1038/nature03877
N1  - 10.1038/nature03877
UR  - http://dx.doi.org/10.1038/nature03877
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Boyer, L. A.
TI  - Polycomb complexes repress developmental regulators in murine embryonic stem cells
JA  - Nature
PY  - 2006///
VL  - 441
SP  - 349
EP  - 353
M3  - 10.1038/nature04733
N1  - 10.1038/nature04733
UR  - http://dx.doi.org/10.1038/nature04733
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Lee, T. I.
TI  - Control of developmental regulators by polycomb in human embryonic stem cells
JA  - Cell
PY  - 2006///
VL  - 125
SP  - 301
EP  - 313
M3  - 10.1016/j.cell.2006.02.043
N1  - 10.1016/j.cell.2006.02.043
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2006.02.043
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Squazzo, S. L.
TI  - Suz12 binds to silenced regions of the genome in a cell-type-specific manner
JA  - Genome Res.
PY  - 2006///
VL  - 16
SP  - 890
EP  - 900
M3  - 10.1101/gr.5306606
N1  - 10.1101/gr.5306606
UR  - http://dx.doi.org/10.1101/gr.5306606
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Pasini, D.
AU  - Bracken, A. P.
AU  - Hansen, J. B.
AU  - Capillo, M.
AU  - Helin, K.
TI  - The Polycomb Group protein Suz12 is required for Embryonic Stem Cell differentiation
JA  - Mol. Cell. Biol.
PY  - 2007///
VL  - 27
SP  - 3769
EP  - 3779
M3  - 10.1128/MCB.01432-06
N1  - 10.1128/MCB.01432-06
UR  - http://dx.doi.org/10.1128/MCB.01432-06
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Klose, R. J.
AU  - Bird, A. P.
TI  - Genomic DNA methylation: the mark and its mediators
JA  - Trends Biochem. Sci.
PY  - 2006///
VL  - 31
SP  - 89
EP  - 97
M3  - 10.1016/j.tibs.2005.12.008
N1  - 10.1016/j.tibs.2005.12.008
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.tibs.2005.12.008
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Wang, X.
AU  - Su, H.
AU  - Bradley, A.
TI  - Molecular mechanisms governing Pcdh-[ggr] gene expression: evidence for a multiple promoter and cis-alternative splicing model
JA  - Genes Dev.
PY  - 2002///
VL  - 16
SP  - 1890
EP  - 1905
M3  - 10.1101/gad.1004802
N1  - 10.1101/gad.1004802
UR  - http://dx.doi.org/10.1101/gad.1004802
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Carninci, P.
TI  - The transcriptional landscape of the mammalian genome
JA  - Science
PY  - 2005///
VL  - 309
SP  - 1559
EP  - 1563
M3  - 10.1126/science.1112014
N1  - 10.1126/science.1112014
UR  - http://dx.doi.org/10.1126/science.1112014
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Alexander, D. L.
AU  - Ganem, L. G.
AU  - Fernandez-Salguero, P.
AU  - Gonzalez, F.
AU  - Jefcoate, C. R.
TI  - Aryl-hydrocarbon receptor is an inhibitory regulator of lipid synthesis and of commitment to adipogenesis
JA  - J. Cell Sci.
PY  - 1998///
VL  - 111
SP  - 3311
EP  - 3322
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Lengner, C. J.
TI  - Primary mouse embryonic fibroblasts: a model of mesenchymal cartilage formation
JA  - J. Cell. Physiol.
PY  - 2004///
VL  - 200
SP  - 327
EP  - 333
M3  - 10.1002/jcp.20118
N1  - 10.1002/jcp.20118
UR  - http://dx.doi.org/10.1002/jcp.20118
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Garreta, E.
AU  - Genove, E.
AU  - Borros, S.
AU  - Semino, C. E.
TI  - Osteogenic differentiation of mouse embryonic stem cells and mouse embryonic fibroblasts in a three-dimensional self-assembling peptide scaffold
JA  - Tissue Eng.
PY  - 2006///
VL  - 12
SP  - 2215
EP  - 2227
M3  - 10.1089/ten.2006.12.2215
N1  - 10.1089/ten.2006.12.2215
UR  - http://dx.doi.org/10.1089/ten.2006.12.2215
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Doetsch, F.
TI  - The glial identity of neural stem cells
JA  - Nature Neurosci.
PY  - 2003///
VL  - 6
SP  - 1127
EP  - 1134
M3  - 10.1038/nn1144
N1  - 10.1038/nn1144
UR  - http://dx.doi.org/10.1038/nn1144
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Krichevsky, A. M.
AU  - Sonntag, K. C.
AU  - Isacson, O.
AU  - Kosik, K. S.
TI  - Specific microRNAs modulate embryonic stem cell-derived neurogenesis
JA  - Stem Cells
PY  - 2006///
VL  - 24
SP  - 857
EP  - 864
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Rao, B.
AU  - Shibata, Y.
AU  - Strahl, B. D.
AU  - Lieb, J. D.
TI  - Dimethylation of histone H3 at lysine 36 demarcates regulatory and nonregulatory chromatin genome-wide
JA  - Mol. Cell. Biol.
PY  - 2005///
VL  - 25
SP  - 9447
EP  - 9459
M3  - 10.1128/MCB.25.21.9447-9459.2005
N1  - 10.1128/MCB.25.21.9447-9459.2005
UR  - http://dx.doi.org/10.1128/MCB.25.21.9447-9459.2005
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Bannister, A. J.
TI  - Spatial distribution of di- and tri-methyl lysine 36 of histone H3 at active genes
JA  - J. Biol. Chem.
PY  - 2005///
VL  - 280
SP  - 17732
EP  - 17736
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Kim, A.
AU  - Kiefer, C. M.
AU  - Dean, A.
TI  - Distinctive signatures of histone methylation in transcribed coding and noncoding human [bgr]-globin sequences
JA  - Mol. Cell. Biol.
PY  - 2007///
VL  - 27
SP  - 1271
EP  - 1279
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Vakoc, C. R.
AU  - Sachdeva, M. M.
AU  - Wang, H.
AU  - Blobel, G. A.
TI  - Profile of histone lysine methylation across transcribed mammalian chromatin
JA  - Mol. Cell. Biol.
PY  - 2006///
VL  - 26
SP  - 9185
EP  - 9195
M3  - 10.1128/MCB.01529-06
N1  - 10.1128/MCB.01529-06
UR  - http://dx.doi.org/10.1128/MCB.01529-06
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Li, B.
AU  - Carey, M.
AU  - Workman, J. L.
TI  - The role of chromatin during transcription
JA  - Cell
PY  - 2007///
VL  - 128
SP  - 707
EP  - 719
M3  - 10.1016/j.cell.2007.01.015
N1  - 10.1016/j.cell.2007.01.015
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2007.01.015
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Fantes, J.
TI  - Mutations in SOX2 cause anophthalmia
JA  - Nature Genet.
PY  - 2003///
VL  - 33
SP  - 461
EP  - 463
M3  - 10.1038/ng1120
N1  - 10.1038/ng1120
UR  - http://dx.doi.org/10.1038/ng1120
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Hutchinson, J. N.
TI  - A screen for nuclear transcripts identifies two linked noncoding RNAs associated with SC35 splicing domains
JA  - BMC Genomics
PY  - 2007///
VL  - 8
SP  - 39
M3  - 10.1186/1471-2164-8-39
N1  - 10.1186/1471-2164-8-39
UR  - http://dx.doi.org/10.1186/1471-2164-8-39
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Seitz, H.
TI  - A large imprinted microRNA gene cluster at the mouse Dlk1-Gtl2 domain
JA  - Genome Res.
PY  - 2004///
VL  - 14
SP  - 1741
EP  - 1748
M3  - 10.1101/gr.2743304
N1  - 10.1101/gr.2743304
UR  - http://dx.doi.org/10.1101/gr.2743304
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Cullen, B. R.
TI  - Transcription and processing of human microRNA precursors
JA  - Mol. Cell
PY  - 2004///
VL  - 16
SP  - 861
EP  - 865
M3  - 10.1016/j.molcel.2004.12.002
N1  - 10.1016/j.molcel.2004.12.002
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2004.12.002
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Zaratiegui, M.
AU  - Irvine, D. V.
AU  - Martienssen, R. A.
TI  - Noncoding RNAs and gene silencing
JA  - Cell
PY  - 2007///
VL  - 128
SP  - 763
EP  - 776
M3  - 10.1016/j.cell.2007.02.016
N1  - 10.1016/j.cell.2007.02.016
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2007.02.016
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Verdel, A.
AU  - Moazed, D.
TI  - RNAi-directed assembly of heterochromatin in fission yeast
JA  - FEBS Lett.
PY  - 2005///
VL  - 579
SP  - 5872
EP  - 5878
M3  - 10.1016/j.febslet.2005.08.083
N1  - 10.1016/j.febslet.2005.08.083
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.febslet.2005.08.083
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Martens, J. H.
TI  - The profile of repeat-associated histone lysine methylation states in the mouse epigenome
JA  - EMBO J.
PY  - 2005///
VL  - 24
SP  - 800
EP  - 812
M3  - 10.1038/sj.emboj.7600545
N1  - 10.1038/sj.emboj.7600545
UR  - http://dx.doi.org/10.1038/sj.emboj.7600545
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Baust, C.
TI  - Structure and expression of mobile ETnII retroelements and their coding-competent MusD relatives in the mouse
JA  - J. Virol.
PY  - 2003///
VL  - 77
SP  - 11448
EP  - 11458
M3  - 10.1128/JVI.77.21.11448-11458.2003
N1  - 10.1128/JVI.77.21.11448-11458.2003
UR  - http://dx.doi.org/10.1128/JVI.77.21.11448-11458.2003
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Svoboda, P.
TI  - RNAi and expression of retrotransposons MuERV-L and IAP in preimplantation mouse embryos
JA  - Dev. Biol.
PY  - 2004///
VL  - 269
SP  - 276
EP  - 285
M3  - 10.1016/j.ydbio.2004.01.028
N1  - 10.1016/j.ydbio.2004.01.028
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.ydbio.2004.01.028
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Cho, D. H.
TI  - Antisense transcription and heterochromatin at the DM1 CTG repeats are constrained by CTCF
JA  - Mol. Cell
PY  - 2005///
VL  - 20
SP  - 483
EP  - 489
M3  - 10.1016/j.molcel.2005.09.002
N1  - 10.1016/j.molcel.2005.09.002
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2005.09.002
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Feng, Y. Q.
TI  - The human [bgr]-globin locus control region can silence as well as activate gene expression
JA  - Mol. Cell. Biol.
PY  - 2005///
VL  - 25
SP  - 3864
EP  - 3874
M3  - 10.1128/MCB.25.10.3864-3874.2005
N1  - 10.1128/MCB.25.10.3864-3874.2005
UR  - http://dx.doi.org/10.1128/MCB.25.10.3864-3874.2005
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Edwards, C. A.
AU  - Ferguson-Smith, A. C.
TI  - Mechanisms regulating imprinted genes in clusters
JA  - Curr. Opin. Cell Biol.
PY  - 2007///
VL  - 19
SP  - 281
EP  - 289
M3  - 10.1016/j.ceb.2007.04.013
N1  - 10.1016/j.ceb.2007.04.013
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.ceb.2007.04.013
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Delaval, K.
TI  - Differential histone modifications mark mouse imprinting control regions during spermatogenesis
JA  - EMBO J.
PY  - 2007///
VL  - 26
SP  - 720
EP  - 729
M3  - 10.1038/sj.emboj.7601513
N1  - 10.1038/sj.emboj.7601513
UR  - http://dx.doi.org/10.1038/sj.emboj.7601513
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Feil, R.
AU  - Berger, F.
TI  - Convergent evolution of genomic imprinting in plants and mammals
JA  - Trends Genet.
PY  - 2007///
VL  - 23
SP  - 192
EP  - 199
M3  - 10.1016/j.tig.2007.02.004
N1  - 10.1016/j.tig.2007.02.004
UR  - http://dx.doi.org/10.1016/j.tig.2007.02.004
ER  -

TY  - JOUR
AU  - Strausberg, R. L.
TI  - Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences
JA  - Proc. Natl Acad. Sci. USA
PY  - 2002///
VL  - 99
SP  - 16899
EP  - 16903
M3  - 10.1073/pnas.242603899
N1  - 10.1073/pnas.242603899
UR  - http://dx.doi.org/10.1073/pnas.242603899
ER  -
