est2genome alignments of the TERF1P cDNAs to the chimpanzee clone PTB-084L06
Note Best alignment is between forward est and forward genome, but splice sites imply REVERSED GENE
Exon 983 95.5 34047 35129 PTB-084L06 1 1088 hsa21-TERF1P
-Intron -20 0.0 35130 35146 PTB-084L06
Exon 1342 96.8 35147 36593 PTB-084L06 1089 2527 hsa21-TERF1P
Span 2305 96.2 34047 36593 PTB-084L06 1 2527 hsa21-TERF1P
Segment 425 95.7 34047 34511 PTB-084L06 1 465 hsa21-TERF1P
Segment 144 98.0 34512 34661 PTB-084L06 472 621 hsa21-TERF1P
Segment 184 97.4 34663 34856 PTB-084L06 622 815 hsa21-TERF1P
Segment 109 96.6 34857 34973 PTB-084L06 817 933 hsa21-TERF1P
Segment 139 94.8 34975 35129 PTB-084L06 934 1088 hsa21-TERF1P
Segment 175 95.8 35152 35342 PTB-084L06 1089 1279 hsa21-TERF1P
Segment 178 97.3 35344 35531 PTB-084L06 1280 1467 hsa21-TERF1P
Segment 18 90.9 35533 35554 PTB-084L06 1468 1489 hsa21-TERF1P
Segment 3 100.0 35555 35557 PTB-084L06 1491 1493 hsa21-TERF1P
Segment 45 97.9 35558 35604 PTB-084L06 1495 1541 hsa21-TERF1P
Segment 1 100.0 35608 35608 PTB-084L06 1542 1542 hsa21-TERF1P
Segment 634 97.5 35610 36277 PTB-084L06 1543 2210 hsa21-TERF1P
Segment 316 100.0 36278 36593 PTB-084L06 2212 2527 hsa21-TERF1P
PTB-084L06 vs hsa21-TERF1P:
PTB-084L06 34047 GCGGATGGTAGGGATGCCAACCCTACCGAGGAGCAGATGGCAGAAACAGA 34096
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 1 GCGGATGGTAGAGATGCCGACCCTACCGAGGAGCAGATGGCAGAAACAGA 50
PTB-084L06 34097 GAGAAACGATGAGGAGCAGTTCAAATGCCAGGAACGGCTCAAGTGCCAGG 34146
||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 51 GAGAAACGACGAGGAGCAGTTCGAATGCCAGGAACGGCTCAAGTGCCAGG 100
PTB-084L06 34147 TGCAGGTGGGGGCCCCCGAGGAGGAGGAGGAGGACGCGGGCCTGGTGGCC 34196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 101 TGCAGGTGGGGGCCCCCGAGGAGGAGGAGGAGGACGCGGGCCTGGTGGCC 150
PTB-084L06 34197 TAGGCTGAGGCCATGGCTGCTGGCTGGATGCTCGATTTCCTCTGCCTCTC 34246
|||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||
hsa21-TERF1P 151 AAGGCCGAGGCCGTGGCTGCAGGCTGGATGCTCGATTTCCTCCGCTTCTC 200
PTB-084L06 34247 TCTTTGCCGAGCTTTCCGCGACGGCCGCTCCAAGGACTTCTGCAGGACCC 34296
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
hsa21-TERF1P 201 TCTTTGCCGAGCTTTCCGCGACGGCCGCTCGGAGGACTTCTGCAGGATCC 250
PTB-084L06 34297 GCAACAGCGCAGAGGCTATTATTCACGGACTATCCACTCTAACAGCTTAC 34346
||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
hsa21-TERF1P 251 GCAACAGGGCAGAGGCTATTATTCATGGACTATCCAGTCTAACAGCTTAC 300
PTB-084L06 34347 CAGTTGAGAATGATATACATATGTCAGTTTTTGACAAGAATTGCAGCAGG 34396
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 301 CAGTTGAGAACGATATACATATGTCAGTTTTTGACAAGAATTGCAGCAGG 350
PTB-084L06 34397 AAAAACCCTTGATGCACAGTTTGAAAATGATGAACGAATTATACCCTTGG 34446
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
hsa21-TERF1P 351 AAAAACCCTTGATGCACAGTTTGAAAATGATGAATGAATTACACCCTTGG 400
PTB-084L06 34447 AATCAGCCCTGATGATTTGGGGTTCAATTGAAAAGGAACATGACAAACTT 34496
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 401 AATCAGCCCTGATGATTTGGGGTTCAACTGAAAAGGAACATGACAAACTT 450
PTB-084L06 34497 CAAGAAGAAATACAG------ACTGAAATTCAGGCTATAGCTGTTTGTAT 34540
||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 451 CAAGAAGAAATACAGAATTTAATTAAAATTCAGGCTATAGCTGTTTGTAT 500
PTB-084L06 34541 GGAAAATGGCAACTTTAAAGAAGCAGAAGTCTTTGAAAGAATATTTGGTG 34590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 501 GGAAAATGGCAACTTTAAAGAAGCAGAAGTCTTTGAAAGAATATTTGGTG 550
PTB-084L06 34591 ATCCAAATTCTTATATGCCTCTCAAAAGCAAATTGCTTGTGATAATCTCT 34640
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
hsa21-TERF1P 551 ATCCAAATTCTTATATGCCTCTCAAAAGCAAATTGCTTATGATAATCTCT 600
PTB-084L06 34641 CAGAAAGATACATTTCATTCCTTTTTTTCAACACTTCAGCTACAACCACA 34690
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
hsa21-TERF1P 601 CAGAAAGATACATTTCATTCC-TTTTTTCAACACTTCAGCTACAATCACA 649
PTB-084L06 34691 TGATGGAGAAAATTAAGAGTTATGTGAATTATGTGCTAAGTGAAAAATCA 34740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 650 TGATGGAGAAAATTAAGAGTTATGTGAATTATGTGCTAAGTGAAAAATCA 699
PTB-084L06 34741 TCAACCTTTCTAATGAAGGCAGCAGCAAAAGTAGTAGAAAGTAAAAGAAC 34790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 700 TCAACCTTTCTAATGAAGGCAGCAGCAAAAGTAGTAGAAAGTAAAAGAAC 749
PTB-084L06 34791 AAGAACAATAACTTCTCAAGATAAACCTAATGGTAATTATGTTGAAATGG 34840
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||
hsa21-TERF1P 750 AAGAACAATAACTTCTCAAGATAAAGCTAATGAAAATTATGTTGAAACGG 799
PTB-084L06 34841 AAACTGAAGCTAATTT-GATACAAGAAAAAGGTCTCACAAGAATCTTTTC 34889
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 800 AAACTGAAGCTAATTTGGATACAAGAAAAAGGTCTCACAAGAATCTTTTC 849
PTB-084L06 34890 TTATCTAAGTTGCAACATGGAACTCAGCAACAAGACCTTAATAAGAAAGA 34939
||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 850 TTATCTAAGTTACAACATGGGACCCAGCAACAAGACCTTAATAAGAAAGA 899
PTB-084L06 34940 AAGAAGAGTAGGAACTCCTCAAAGTACAAAAAAGAAAAAAAGAAAGCAGA 34989
||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
hsa21-TERF1P 900 AAGAAGAGTAGGAACTCTTCAAAGTACAAAAAAG-AAAAAAGAAAGCAGA 948
PTB-084L06 34990 AGAGCCACTGAAAGCAGAATACCTGTTTCAAAGAGGCAACCGGTAACTCC 35039
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
hsa21-TERF1P 949 AGAGCCACTGAAAGCTGAATACCTGTTTCAAAGAGTCAACCGGTAACTCC 998
PTB-084L06 35040 TGAAAAACATCGAGCTAGAAAAGGACAGTCATGGCTTTGGGAAGAAGACA 35089
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||
hsa21-TERF1P 999 TGAAAAACATCGAGCTAGAAAAAGACAGGCATGGCTTCAGGAAGAAGACA 1048
PTB-084L06 35090 GGAATTTGAGATCTGGCATGAGGAAATATGGAGAGGGAAActggt....a 35129
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| <<<<< 17 <
hsa21-TERF1P 1049 AGAATTTGAGATCTGGCATGAGGAAATATGGAGAGGGAAT.......... 1088
PTB-084L06 35129 ctacTGCATTATAAATTCAACAACCAGACAAGTGTCATGTTAAAAGACAG 35192
<<<< |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 1088 ....-----TATAAATTCAACAACCGGACAAGTGTCATGTTAAAAGACAG 1129
PTB-084L06 35193 ATTGAGGACCATGAAGAAACTAAAACTGATTTGCTCAGACAGCAAAGACT 35242
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
hsa21-TERF1P 1130 ATGGAGGACCATGAAGAAACTAAAACTGATTTGCTCAGACAGCGAAGACT 1179
PTB-084L06 35243 GATTGTGTTTGTAAAAGCTTTATGAAAGGACAATTAAGTATTTTGATCAC 35292
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 1180 GATTGTGTTTGTAAAAGCTTGATGAAAGGACAGTTAAGTATTTTGATCAC 1229
PTB-084L06 35293 TGCATTTTGTTTGAAACTTGTGTCATTGATGTGTTTTAAAACTTCTATTT 35342
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||
hsa21-TERF1P 1230 TGCATTTTGTTTGAAACTTGTGTCATTGATGTATTTTAAAACTTTTGTTT 1279
PTB-084L06 35343 AAAGAATTACAGCATTTTTCTGTGGCCATCAATTAATATGAGGGTTTGTG 35392
||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 1280 -AAGCATTACAGTATTTTTCTGTGACCATCAATTAATATGAGGGTTTGTG 1328
PTB-084L06 35393 CTATAAGAGTTAAAGCATATGCTATCATTGTATTCTTTAAGAACTTTATT 35442
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 1329 CTATAAGAGTTAGAGCATATGCTATCATTGTATTCTTTAAGAACTTTATT 1378
PTB-084L06 35443 TTGATAAAATGTAAATTTGTTGAACCCTGCCACATTTAGTATCCCCACCC 35492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 1379 TTGATAAAATGTAAATTTGTTGAACCCTGCCACATTTAGTATCCCCACCC 1428
PTB-084L06 35493 CCAAAACCTGTTCCAATGAAAAAATTAAAACCTGTTGCGAAAAAAAAAAA 35542
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
hsa21-TERF1P 1429 CCAAAACCTGTTCCAATGAAAAAATTAAAACCTGTTACG-AAAAAAAAAT 1477
PTB-084L06 35543 TCAGTTAACTTA-TTT-TGTCTGTAGGCTGACCTCAACCCTGTAACATAA 35590
||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||
hsa21-TERF1P 1478 TCAGTTAACCTATTTTGTGTCTGTAGGCTGACCTCAACACTGTAACATAA 1527
PTB-084L06 35591 CCCATTAAAATGAATTTTCTTTTTTTTTAAGACAGAGTTTCTCTCTGTCA 35640
|||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 1528 CCCATTAAAATGAA---T-TTTTTTTTTAAGACAGAGTTTCTCTCTGTCA 1573
PTB-084L06 35641 CCCAAGCTGGAATGCAATGGCACAATTTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCT 35690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 1574 CCCAAGCTGGAATGCAATGGCACAATTTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCT 1623
PTB-084L06 35691 CCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 35740
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 1624 CCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 1673
PTB-084L06 35741 TGGGCACACAGCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCA 35790
| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 1674 TAGGCACACACCACCATGTCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCG 1723
PTB-084L06 35791 GGGTTTCACCATGCTGGTCAGGATGGTCTCGAACTCCTGACTTCATGATC 35840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 1724 GGGTTTCACCATGCTGGTCAGGATGGTCTCGAACTCCTGACTTCATGATC 1773
PTB-084L06 35841 CACTCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGACGTGAGCCACTGT 35890
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
hsa21-TERF1P 1774 CACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGAAGTGAGCCACTGT 1823
PTB-084L06 35891 GTCCTGCCTAAAATGAATTTTCTAGACGATTGAATAACAGTAGTCCTTTG 35940
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 1824 GTCCTGCCTAAAATGAATTTTCTAGACGACTGAATAACAGTAGTCCTTTG 1873
PTB-084L06 35941 ATAGGAGATAATGACTTGGTTTATGGCCTTAACATACTACTTAATTACTT 35990
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
hsa21-TERF1P 1874 ATAGGAGATAATGACTTGGTTTATGGCCTTAATACACTACTTAATTACTT 1923
PTB-084L06 35991 AAGATGTTTATTAATAGAATGATAAATGTACAGAGTAACCTATAAGCGTG 36040
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
hsa21-TERF1P 1924 AAGATGTTTATTAATAGAATGATAAATGTACAGAGTAACCTACAAGCATG 1973
PTB-084L06 36041 ACACACTTTTGCTTTCAGTAGTTTCATGTAAAGAAAAAAACTTGAAAATA 36090
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 1974 ACATACTTTTGCTTTCAGTAGTTTCATGTAAAGAAAAAAACTTGAAAATA 2023
PTB-084L06 36091 GTAATACCTGAGGACCCATGGGAATAATAGACACTAGGGAGGTAGGGTGG 36140
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
hsa21-TERF1P 2024 GTAATACCTGAGGACCCATGGGAATAACAGACACTGGGGAGGTAGGGTGG 2073
PTB-084L06 36141 GGAGCGAGAACAAGAGCTGAAAAACTACCTACTGGGGACTCTGCTCACTA 36190
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
hsa21-TERF1P 2074 GGAGCGGGAACAAGAGCTGAAAAACTACCTACTGGGGACTCTTCTCACTA 2123
PTB-084L06 36191 CCTGGGTGACAGGATCATCCATACCCTAAACCTCAACATCACACAGTACA 36240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 2124 CCTGGGTGACAGGATCATCCATACCCTAAACCTCAACATCACACAGTACA 2173
PTB-084L06 36241 CCCAGCTAACAAACCTGCCCATGTGTTCCCTGAATCT-AAAAAAAATTGA 36289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
hsa21-TERF1P 2174 CCCAGCTAACAAACCTGCCCATGTGTTCCCTGAATCTAAAAAAAAATTGA 2223
PTB-084L06 36290 AATAATTGTTTTAAAAAAGAAAAAGACAATAGTATTACCCATGGGACAAA 36339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 2224 AATAATTGTTTTAAAAAAGAAAAAGACAATAGTATTACCCATGGGACAAA 2273
PTB-084L06 36340 ATTTGTACTATTAGCAAGAATCATTTGTGTCTCATTTAGAAACAATTTGA 36389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 2274 ATTTGTACTATTAGCAAGAATCATTTGTGTCTCATTTAGAAACAATTTGA 2323
PTB-084L06 36390 CTTTTGTTCCAGTGTTTAAACTTTGACAAAAATGGTTTTGAATAGATCTT 36439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 2324 CTTTTGTTCCAGTGTTTAAACTTTGACAAAAATGGTTTTGAATAGATCTT 2373
PTB-084L06 36440 TATAACCTGATGCCATAAATACAAGATTCTCTGATACCTTCATTTAATAT 36489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 2374 TATAACCTGATGCCATAAATACAAGATTCTCTGATACCTTCATTTAATAT 2423
PTB-084L06 36490 ATCAATATTGGGCCTAAAAGAGTATTCTATAAAGCTTAAATTGGTATTAA 36539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 2424 ATCAATATTGGGCCTAAAAGAGTATTCTATAAAGCTTAAATTGGTATTAA 2473
PTB-084L06 36540 CTATGATCATCTTGATGTCTATGATAGATAATAAACAAGGTCATACATAC 36589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-TERF1P 2474 CTATGATCATCTTGATGTCTATGATAGATAATAAACAAGGTCATACATAC 2523
PTB-084L06 36590 CTTA 36593
||||
hsa21-TERF1P 2524 CTTA 2527
Alignment Score: 2305
