est2genome alignments of the CYP4F3LP cDNAs to the chimpanzee clone PTB-084L06
Note Best alignment is between reversed est and forward genome, and splice sites imply forward gene
Exon 306 99.4 101142 101451 PTB-084L06 1 310 hsa21-CYP4F3LP
+Intron -20 0.0 101452 101777 PTB-084L06
Exon 158 98.2 101778 101941 PTB-084L06 311 474 hsa21-CYP4F3LP
+Intron -20 0.0 101942 104751 PTB-084L06
Exon 1857 98.5 104752 106669 PTB-084L06 475 2389 hsa21-CYP4F3LP
Span 2281 98.6 101142 106669 PTB-084L06 1 2389 hsa21-CYP4F3LP
Segment 306 99.4 101142 101451 PTB-084L06 1 310 hsa21-CYP4F3LP
Segment 158 98.2 101778 101941 PTB-084L06 311 474 hsa21-CYP4F3LP
Segment 1517 98.6 104752 106312 PTB-084L06 475 2035 hsa21-CYP4F3LP
Segment 2 75.0 106314 106317 PTB-084L06 2036 2039 hsa21-CYP4F3LP
Segment 344 99.1 106320 106669 PTB-084L06 2040 2389 hsa21-CYP4F3LP
PTB-084L06 vs hsa21-CYP4F3LP:
PTB-084L06 101142 TTGGTGGCTTCAACAGCAACATCTTTATTGCCAGCAAAACCCTGGGGAGG 101191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1 TTGGTGGCTTCAACAGCAACATCTTTATTGCCAGCAAAACCCTGGGGAGG 50
PTB-084L06 101192 AGGAAACCAGCTTAGTGCCAGCACCAACTGCCACTCACAGGCTGGGGTAA 101241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 51 AGGAAACCAGCTTAGTGCCAGCACCAACTGCCACTCACAGGCTGGGGTAA 100
PTB-084L06 101242 TCATGGGACTGGGAGGGAGGGATCTGGGTGGTAGAGCTTGCTGCCCAGCA 101291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 101 TCATGGGACTGGGAGGGAGGGATCTGGGTGGTAGAGCTTGCTGCCCAGCA 150
PTB-084L06 101292 GGATATGGCAAGGATGTCCCTGCAGTCAGGCTGTTGGACCTTTGCCCAGG 101341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 151 GGATATGGCAAGGATGTCCCTGCAGTCAGGCTGTTGGGCCTTTGCCCAGG 200
PTB-084L06 101342 AGGACGCGATAAGGATGTTTCTGCAGTCACGTGGTTAGGAAGGATGTTTC 101391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 201 AGGACGCGATAAGGATGTTTCTGCAGTCACGTGGTTAGGAAGGATGTTTC 250
PTB-084L06 101392 TCATGGCCCAAGTTCCCATGGAATGTTTCACTGTGATCAGAGTCTGCAAA 101441
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 251 TCATGGCCCAAGTTCCCATGGAACGTTTCACTGTGATCAGAGTCTGCAAA 300
PTB-084L06 101442 ATGGCTGGAGgttta.....ctgagAAATGTGGAGGGGACTATGGAGAAC 101802
||||||||||>>>>> 326 >>>>>||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 301 ATGGCTGGAG...............AAATGTGGAGGGGACTATGGAGAAT 335
PTB-084L06 101803 GACAAGCCCCTGAAGCAACCCCAGGATTGGGAGGGCAAACCCAGCACCAG 101852
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
hsa21-CYP4F3LP 336 GACAAGCCCCTGAAGCAACCCCAGGATTGGGAGGGCAAACCCGGCACCAG 385
PTB-084L06 101853 GAGGGCAATGGAATGGCCTGACCTGTGCGTCCTTCATGCTTCCTTCCTCA 101902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
hsa21-CYP4F3LP 386 GAGGGCAATGGAATGGCCTGACCTGTGCGTCCTTCATGCTTCCTTTCTCA 435
PTB-084L06 101903 GTGATGCACAAACAGAAACATGGGGCAATTTCGTGCAGGgtcca...... 101941
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>>> 2810
hsa21-CYP4F3LP 436 GTGATGCACAAACAGAAACATGGGGCAATTTCGTGCAGG........... 474
PTB-084L06 101941 aacagGCCATGAGGCCCTGCACCCACCATTCAATGTCTTCAGGATTGCGG 104796
>>>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
hsa21-CYP4F3LP 474 .....GCCATGAGGCCCTGCACCCACCATTCAATGTCTTCAGGATTGTGG 519
PTB-084L06 104797 TCCCTCAGAACTCTTGCACCACGTGATGGCATCACTCCTGGGTGTCTTCT 104846
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 520 TCCCTCAGAACTCTTGCACCACATGATGGCATCACTCCTGGGTGTCTTCT 569
PTB-084L06 104847 GAGGTTGCATAGGATTCAGTAGAGGCCAGTGGCTGTGCTGTCATATCCTA 104896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 570 GAGGTTGCATAGGATTCAGTAGAGGCCAGTGGCTGTGCTGTCATATCCTA 619
PTB-084L06 104897 AGAGGCAGCCACGCAGGCTTGGGTCTCTTGGCTGCTTCAGCACCAGAGGT 104946
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 620 AGAGGCAGCCACGCAGGCTTGCGTCTCTTGGCTGCTTCAGCACCAGAGGT 669
PTB-084L06 104947 TGGACAGCGCCCATGCACTGAGGCCCTTGGGAGAATGGGAGGAGGGAAAG 104996
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 670 TGGACAGCGCCCATGCACTGAGGCCCTCGGGAGAATGGGAGGAGGGAAAG 719
PTB-084L06 104997 GAAGGGCAGAATGGAGTGACGTAGTGTCCATCCACCATGTCCCTGGATGG 105046
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 720 GAAGGGCAGAATGGAGTGATGTAGTGTCCATCCACCATGTCCCTGGATGG 769
PTB-084L06 105047 AGAGACCCACACCGGGACCACCGCTGGTACTCATGAAGATGTCAGCCTCC 105096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
hsa21-CYP4F3LP 770 AGAGACCCACACCGGGACCACCGCTGGTACTCATGAAGATGCCAGCCTCC 819
PTB-084L06 105097 ATTTATATGTCCTCATCTGACAACTCCTTCCCATTTTCATCCTGGAGACA 105146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 820 ATTTATATGTCCTCATCTGACAACTCCTTCCCATTTTCATCCTGGAGACA 869
PTB-084L06 105147 AGACCTCTGAACACATTAGCTCTGAGGGCACCTGAGTGTAACCTGAGACA 105196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 870 AGACCTCTGAACACATTAGCTCTGAGGGCACCTGAGTGTAACCTGAGACA 919
PTB-084L06 105197 GTCCCTGAAGACTTTCCATCCAAGCAGGATCCCTCCCTTGCCATCTCCAG 105246
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 920 GTCCCTGAAGACTTTTCATCCAAGCAGGATCCCTCCCTTGCCATCTCCAG 969
PTB-084L06 105247 ACCTGCCCCACAAGCTCCCTCCCAGGTCTCCTGGCTCTTGTTCACTCCTT 105296
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 970 ACCTGCCCCACAAGCTCCCTCCCGGGTCTCCTGGCTCTTGTTCACTCCTT 1019
PTB-084L06 105297 CCAGGCAGCCTTCTACAGTCATCTCTAAAATATATCTGACTGTCCCTCCT 105346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1020 CCAGGCAGCCTTCTACAGTCATCTCTAAAATATATCTGACTGTCCCTCCT 1069
PTB-084L06 105347 TTATCCAGCACCTTCTATGGCTCCCCAGAGCCCTCCAGATCAAGTTCAAG 105396
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1070 TTATCCAGCACCTTCTATGGCTCCCCAGAGCCCTCCAGCTCAAGTTCAAG 1119
PTB-084L06 105397 TTCTTTGATCAGACATTTGATCTCAAGCTGCATTTTACCTCCCAAATTAA 105446
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1120 TTCTTTGATCAGACATTTGATCTCAAGCTGCATTCTACCTCCCAAATTAA 1169
PTB-084L06 105447 GATACCGGAGAAGCCACCTTGCCCAGCACAAGTGCATCACTGAAGTCCCA 105496
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1170 GATACTGGAGAAGCCACCTTGCCCAGCACAAGTGCATCACTGAAGTCCCA 1219
PTB-084L06 105497 AGTCTTGAACGTGGCCTTGGCCTTGAGGAAGTCATGAACACCCTGGCTAG 105546
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1220 AGTCTTGAACGTGGCCTTGGTCTTGAGGAAGTCATGAACACCCTGGCTAG 1269
PTB-084L06 105547 TGAGGGTGCAGTGCTGCTCCAGGATGATGGTGTCTAAAGTTGTGCACAAG 105596
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1270 TGAGGGTGCAGGGCTGCTCCAGGATGATGGTGTCTAAAGTTGTGCACAAG 1319
PTB-084L06 105597 GTCACAGGCCCTGCAGAAGCATCACCCCTCAGGAATGGGTAGTACAGGAA 105646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1320 GTCACAGGCCCTGCAGAAGCATCACCCCTCAGGAATGGGTAGTACAGGAA 1369
PTB-084L06 105647 GTCCATGCACAGGCAGATCTGCTGGTGCCATTACACTATGAGGGCACTGA 105696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1370 GTCCATGCACAGGCAGATCTGCTGGTGCCATTACACTATGAGGGCACTGA 1419
PTB-084L06 105697 GCTCAAATAGGGTGGCAATATATTCACTGGGATTCCTGCAAGGTGAGGCT 105746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1420 GCTCAAATAGGGTGGCAATATATTCACTGGGATTCCTGCAAGGTGAGGCT 1469
PTB-084L06 105747 GGGGAGAGGAAGCAGCTCCATAACACATATGAAACCCTGGAAACCCTTCT 105796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1470 GGGGAGAGGAAGCAGCTCCATAACACATATGAAACCCTGGAAACCCTTCT 1519
PTB-084L06 105797 CAGCCAAAATCTCAGGACCACATTACACCCAGAAATGGGTGCCCTCTGAG 105846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1520 CAGCCAAAATCTCAGGACCACATTACACCCAGAAATGGGTGCCCTCTGAG 1569
PTB-084L06 105847 CACACTTGTCTCTCTGTCTCCCACTCTGAGCTCCCTCATGGCCCCACATG 105896
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1570 CACAATTGTCTCTCTGTCTCCCACTCTGAGCTCCCTCATGGCCCCACATG 1619
PTB-084L06 105897 CCCCAGCCTGGCCCAGAGCTTGAAGCCCAGTAACTGTTCAGTCCATGGTG 105946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1620 CCCCAGCCTGGCCCAGAGCTTGAAGCCCAGTAACTGTTCAGTCCATGGTG 1669
PTB-084L06 105947 TTGACTGCTCCCTGGGACAGGAGAGCGCTTGGTGGCTCTGGGACTCCTCC 105996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1670 TTGACTGCTCCCTGGGACAGGAGAGCGCTTGGTGGCTCTGGGACTCCTCC 1719
PTB-084L06 105997 TGTGGAACCCCTGCGTCTGCCTTGGGACCTCCCAATTCCCATGGGAAGCC 106046
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1720 TGTGGAACCCCTGCATCTGCCTTGGGACCTCCCAATTCCCATGGGAAGCC 1769
PTB-084L06 106047 CCCATGGCTCTGGATCGCCCCACCTGCCCTGGGATCCTCCAGCCCCATAA 106096
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1770 CCCATGGCTCTGGATTGCCCCACCTGCCCTGGGATCCTCCAGCCCCATAA 1819
PTB-084L06 106097 GACTTACTTGATGCCTTAGCCCTCCCAGAACATGACATGTTTCTCAGAAT 106146
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1820 GACTTACTTGATGCCTTAGACCTCCCAGAACATGACATGTTTCTCAGAAT 1869
PTB-084L06 106147 GTGGCTGATGTCCAGGGCCATCTGTGGATGTTTCTGGGGACTTCTTGCTG 106196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
hsa21-CYP4F3LP 1870 GTGGCTGATGTCCAGGGCCATCTGTGGATGTTTCTGGGGACTTCTAGCTG 1919
PTB-084L06 106197 ATTTCCTTTACGGTCTGTAGGGCAGGGCCAAGAGGAGAAACCAGCCCAAA 106246
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1920 ATTTCCTTTATGGTCTGTAGGGCACGGCCAAGAGGAGAAACCAGCCCAAC 1969
PTB-084L06 106247 CTCAGAACGGACAAAAGGCTCACTGCCCCAATGGCAACCACCAAACTGTC 106296
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 1970 CTCAGAATGGACAAAAGGCTCACTGCCCCAATGGCAACCACCAAACTGTC 2019
PTB-084L06 106297 AGCAGTGCTTCTGAAACGAAAGGAGGTTTCATTCTGCAGAAAGCTCCTTG 106346
|||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 2020 AGCAGTGCTTCTGAAA-GGAA--AGGTTTCATTCTGCAGAAAGCTCCTTG 2066
PTB-084L06 106347 TTTGGCTTCTTTCTGACGCCAGGGAGGGGTACCAATCCCTGCATACCTGT 106396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 2067 TTTGGCTTCTTTCTGACGCCAGGGAGGGGTACCAATCCCTGCATACCTGT 2116
PTB-084L06 106397 GGTGCCTATGTTACCATCTCTGCCTAGGATGTGCAATGGGCCCCTGCTCC 106446
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 2117 GGTGCCTACGTTACCATCTCTGCCTAGGATGTGCAATGGGCCCCTGCTCT 2166
PTB-084L06 106447 CACTGCAGGGTTGACGTTACCTCCAGCTGGAGACCTGGGCTCCTGACACC 106496
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 2167 CACTGCGGGGTTGACGTTACCTCCAGCTGGAGACCTGGGCTCCTGACACC 2216
PTB-084L06 106497 GCCTGGCCTCTTTGTCCTTCTCTGGATGAGGGTGGAAAGGCTGTACCTGG 106546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 2217 GCCTGGCCTCTTTGTCCTTCTCTGGATGAGGGTGGAAAGGCTGTACCTGG 2266
PTB-084L06 106547 TATTTCCCTAGGTCCTTGGTTTCCACCTTCTAAACATCCAGCAGGAGTGA 106596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 2267 TATTTCCCTAGGTCCTTGGTTTCCACCTTCTAAACATCCAGCAGGAGTGA 2316
PTB-084L06 106597 CCATGCCCAGCACCACACCTGAAGTGGGACTCCCTTGTGGAGCAGCCAAG 106646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 2317 CCATGCCCAGCACCACACCTGAAGTGGGACTCCCTTGTGGAGCAGCCAAG 2366
PTB-084L06 106647 AAATCTACAGATGGAAGAATGCT 106669
|||||||||||||||||||||||
hsa21-CYP4F3LP 2367 AAATCTACAGATGGAAGAATGCT 2389
Alignment Score: 2281
