est2genome alignments of the C21orf34 cDNAs to the chimpanzee clone RP43-172K02
Note Best alignment is between forward est and forward genome, and splice sites imply forward gene
Exon 117 100.0 210 326 RP43-172K02 504 620 hsa21-C21orf34_AF486622
Span 117 100.0 210 326 RP43-172K02 504 620 hsa21-C21orf34_AF486622
Segment 117 100.0 210 326 RP43-172K02 504 620 hsa21-C21orf34_AF486622
RP43-172K02 vs hsa21-C21orf34_AF486622:
RP43-172K02 210 AGATGACAAGAGCACCTCAAAGGCAGCAGCCTCAAGGAGCAGCCATGGCC 259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AF486622 504 AGATGACAAGAGCACCTCAAAGGCAGCAGCCTCAAGGAGCAGCCATGGCC 553
RP43-172K02 260 CCAGACTTGTCGCACGGATGCAGAAAACTTAATGGAGGAGGCTGAGGTCA 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AF486622 554 CCAGACTTGTCGCACGGATGCAGAAAACTTAATGGAGGAGGCTGAGGTCA 603
RP43-172K02 310 GAATGGGAAGAGTTTTT 326
|||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AF486622 604 GAATGGGAAGAGTTTTT 620
Alignment Score: 117
Note Best alignment is between forward est and forward genome, and splice sites imply forward gene
Exon 2691 98.2 194 2999 RP43-172K02 678 3475 hsa21-C21orf34_AK095614
Span 2691 98.2 194 2999 RP43-172K02 678 3475 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 3 71.4 194 200 RP43-172K02 678 684 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 3 71.4 201 207 RP43-172K02 686 692 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 1 100.0 209 209 RP43-172K02 693 693 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 832 99.6 211 1048 RP43-172K02 694 1531 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 29 100.0 1050 1078 RP43-172K02 1532 1560 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 1 100.0 1081 1081 RP43-172K02 1561 1561 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 492 98.8 1085 1588 RP43-172K02 1562 2065 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 548 98.6 1589 2152 RP43-172K02 2070 2633 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 1 100.0 2154 2154 RP43-172K02 2634 2634 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 2 100.0 2156 2157 RP43-172K02 2635 2636 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 709 98.4 2160 2892 RP43-172K02 2637 3369 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 106 100.0 2894 2999 RP43-172K02 3370 3475 hsa21-C21orf34_AK095614
RP43-172K02 vs hsa21-C21orf34_AK095614:
RP43-172K02 194 TTCATTC-TCAAACTCTAGATGACAAGAGCACCTCAAAGGCAGCAGCCTC 242
|| || | || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 678 TTTATACATCCAAAT-T-GATGACAAGAGCACCTCAAAGGCAGCAGCCTC 725
RP43-172K02 243 AAGGAGCAGCCATGGCCCCAGACTTGTCGCACGGATGCAGAAAACTTAAT 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 726 AAGGAGCAGCCATGGCCCCAGACTTGTCGCACGGATGCAGAAAACTTAAT 775
RP43-172K02 293 GGAGGAGGCTGAGGTCAGAATGGGAAGAGTTTTTAAAAAATAAAAAGGGG 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 776 GGAGGAGGCTGAGGTCAGAATGGGAAGAGTTTTTAAAAAATAAAAAGGGG 825
RP43-172K02 343 AGCTAATATGTGAGGAACTGATTGCTGCGCATTATTTTCCACTGAACAGA 392
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 826 AGCTAATATGTGAGGAACTGATTGCTGTGCATTATTTTCCACTGAACAGA 875
RP43-172K02 393 CCTTCTTTTAACTTCTAATCTCAAGCACATAGCAGCTGTTGTTTTCATAT 442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 876 CCTTCTTTTAACTTCTAATCTCAAGCACATAGCAGCTGTTGTTTTCATAT 925
RP43-172K02 443 CAAAGATCAGTAAGTGTTTGTTGAATGAATGTATAAATTCTTCCCCAATC 492
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 926 TAAAGATCAGTAAGTGTTTGTTGAATGAATGTATAAATTCTTCCCCAATC 975
RP43-172K02 493 TCTGTTCCATGTAATAAGAACTAAGTTAGCATTCAATTATAAAGAGGACT 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 976 TCTGTTCCATGTAATAAGAACTAAGTTAGCATTCAATTATAAAGAGGACT 1025
RP43-172K02 543 TAGAAAGTCTGCAGACATTTTTGATCAAAAATCCTTTTAACTGTCTTCTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1026 TAGAAAGTCTGCAGACATTTTTGATCAAAAATCCTTTTAACTGTCTTCTT 1075
RP43-172K02 593 ATGGTTCCCGGTAACACCTAAGCCCAAAAAACTCAGGTCATTTCTTGCCT 642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1076 ATGGTTCCCGGTAACACCTAAGCCCAAAAAACTCAGGTCATTTCTTGCCT 1125
RP43-172K02 643 GTACTGTTGCAATAGCCTCATAATAACTAGTCTTCTCCTTTATCAACCAC 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1126 GTACTGTTGCAATAGCCTCATAATAACTAGTCTTCTCCTTTATCAACCAC 1175
RP43-172K02 693 AGTCGTCTCCACTACACAAAGAAGAGAGGGTGCTAATCTAAAGTGTAAAT 742
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1176 AGTCGTCTCCGCTACACAAAGAAGAGAGGGTGCTAATCTAAAGTGTAAAT 1225
RP43-172K02 743 TATTTTAAATCAGCACCCTTCTTGTAATTTCCCAGTGGTTTTTCCTGTCA 792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1226 TATTTTAAATCAGCACCCTTCTTGTAATTTCCCAGTGGTTTTTCCTGTCA 1275
RP43-172K02 793 TAAGAATAACATGCAAAATTCCTTGCTTGCAAAGCCAGGTATGACCTTGC 842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1276 TAAGAATAACATGCAAAATTCCTTGCTTGCAAAGCCAGGTATGACCTTGC 1325
RP43-172K02 843 CCCGTCTACCTTACTGGCATCGTCTCTCATGACTCTTCCCCTTTTTCACT 892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1326 CCCGTCTACCTTACTGGCATCGTCTCTCATGACTCTTCCCCTTTTTCACT 1375
RP43-172K02 893 CTCCATCTTGCCTTTTCCCAACCATGCCTGCTAGTGAGCCTTAGCCCTTG 942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1376 CTCCATCTTGCCTTTTCCCAACCATGCCTGCTAGTGAGCCTTAGCCCTTG 1425
RP43-172K02 943 TGTTTTCTCTGCCAGGGATGCATGACTGGCTTCTTTACTTTATTCTGATC 992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1426 TGTTTTCTCTGCCAGGGATGCATGACTGGCTTCTTTACTTTATTCTGATC 1475
RP43-172K02 993 TCTCTGCTCAAATGTCATCTTTTTAGAGATAGCTTTCCTAAACATCTTTA 1042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1476 TCTCTGCTCAAATGTCATCTTTTTAGAGATAGCTTTCCTAAACATCTTTA 1525
RP43-172K02 1043 AAAGTACCCCCATGAACTGTGAAACACCTTTCCTGCTTTAAGTTTTCTTC 1092
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1526 AAAGTA-CCCCATGAACTGTGAAACACCTTTCCTGC--T---TTTTCTTC 1569
RP43-172K02 1093 ATAGTACTTATCACTTCCTGATATTATGTTAGACAACAAGCAAATAAGTA 1142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1570 ATAGTACTTATCACTTCCTGATATTATGTTAGACAACAAGCAAATAAGTA 1619
RP43-172K02 1143 TATGCTGTTCCCACTAAAATATAAGCTCCATTTGAACAGGAGCCTTGATT 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1620 TATGCTGTTCCCACTAAAATATAAGCTCCATTTGAACAGGAGCCTTGATT 1669
RP43-172K02 1193 ATTCCTGAGTATACCCCTAGTGCCCAGAACCTAGTAGGACTTTAATAAAT 1242
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1670 ATTCCTGAGTATACCCCTAGTGCCCAGAACCTAGTAGGGCTTTAATAAAT 1719
RP43-172K02 1243 ATTAGATTCATTTGTTGAATGAAAAAATGAATGAATAATTGAATAAAGAT 1292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1720 ATTAGATTCATTTGTTGAATGAAAAAATGAATGAATAATTGAATAAAGAT 1769
RP43-172K02 1293 ATCCAGGTAGAGTGTCCGGGCAGCCCAACCTATGTGAAGCCAGTACAAGA 1342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1770 ATCCAGGTAGAGTGTCCGGGCAGCCCAACCTATGTGAAGCCAGTACAAGA 1819
RP43-172K02 1343 ATGTATCTGTGACATAGTGAATGCAATTATTCCTCCAAATGATGAACTTG 1392
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1820 ATGTTTCTGTGACATAGTGAGCGCAATTATTCCTCTAAATGATGAACTTG 1869
RP43-172K02 1393 CATGAGTACACAAGGATAAAATTAAGCACGTAGTTTAGATTTCTGCAAGT 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1870 CATGAGTACACAAGGATAAAATTAAGCACGTAGTTTAGATTTCTGCAAGT 1919
RP43-172K02 1443 CTCTTCCTCAGATTGAGGAAAAACAAAGAAATTGAGCTTATTCTCACCTC 1492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1920 CTCTTCCTCAGATTGAGGAAAAACAAAGAAATTGAGCTTATTCTCACCTC 1969
RP43-172K02 1493 ATTCTTACATGAACTAAATCCAGAATAAAGCATCATTTATATACCAAGCA 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1970 ATTCTTACATGAACTAAATCCAGAATAAAGCATCATTTAAATACCAAGCA 2019
RP43-172K02 1543 CATCCCTACCTCAGCCACTCATGGAATACTTTATCTGTAAAGGGAC---- 1589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2020 CATCCCTACCTCAGCCACTCATGGAATACTTTATCTGTAAAGGGACAGAT 2069
RP43-172K02 1589 AGATAGTAAATATTTTTGGCTTTGGGGACCGTAGAGTCTGTGTCCCCGCT 1638
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||
hsa21-C21orf34_AK095614 2070 AGATAGTAAATATTTTTGGCTTTGGGGACCGTACAGTCTGTGTCGCCACT 2119
RP43-172K02 1639 ACTCAGCACTTCTGTTGAGGTGTGGAATCAGCCCTAGACAACACAGAAAC 1688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2120 ACTCAGCACTTCTGTTGAGGTGTGGAATCAGCCCTAGACAACACATAAAC 2169
RP43-172K02 1689 AAATGGGTGTGGCTGTGTTCCAATCAAATGTTATTTATAAAACTAGGAAA 1738
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2170 AAATGGGTGTGGCTGTGTTCCAATAAAATGTTATTTATAAAACTAGGAAA 2219
RP43-172K02 1739 TCAGCAGATTTAGTCCACAGGCTGTAGTTTGCTGACCCTTGAATTAGAGA 1788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2220 TCAGCAGATTTAGTCCACAGGCTGTAGTTTGCTGACCCTTGAATTAGAGA 2269
RP43-172K02 1789 GTCTTCCCCAAATCCTCTTCCCAAGTTATTGAAAGAATGCCCATAGGACC 1838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2270 GTCTTCCCCAAATCCTCTTCCCAAGTTATTGAAAGAATGCCCATAGGACC 2319
RP43-172K02 1839 ATAGCTCCCTCACCTGGTTCTTTCAAGAAATGAGACAAATTCAGGGATGG 1888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2320 ATAGCTCCCTCACCTGGTTCTTTCAAGAAATGAGACAAATTCAGGGATGG 2369
RP43-172K02 1889 TTGGAGGGTGGAACGCCTACCTGTGACATGACTATTGAGCCTGATTTCTT 1938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2370 TTGGAGGGTGGAACGCCTACCTGTGACATGACTATTGAGCCTGATTTCTT 2419
RP43-172K02 1939 TCCTTTTATCTCTTTAAAGTGAGTCAGGTCTTAACTTTAAACTGTCTCTA 1988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2420 TCCTTTTATCTCTTTAAAGTGAGTCAGGTCTTAACTTTAAACTGTCTCTA 2469
RP43-172K02 1989 AAGTGGCAATAACTGGGCCATGTCAAATACTCCCAATGACAAAATTTCTT 2038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2470 AAGTGGCAATAACTGGGCCATGTCAAATACTCCCAATGACAAAATTTCTT 2519
RP43-172K02 2039 CTTGGAGAATGAATGGGGGTTGCATACAGTGGTGTGTTGGTAAATGTTTA 2088
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2520 CTTGGAGAATGAATGAGGGTTGCATACAGTGGTGTGTTGGTAAATGTTTA 2569
RP43-172K02 2089 GCAACTGGCTCTCTTACTGATTTCCGTAGTGTAAATTCTGCCATCCTGGC 2138
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2570 GCAACTGGCTCTCTTACTGATTTCTGTAGTGTAAATTCTCCCATCCTGGC 2619
RP43-172K02 2139 CATCTGAAACTACCAATATGAATGATGTCACTTGATGTAGAGTTGGGAAA 2188
|||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2620 CATCTGAAACTACC-A-AT--ATGATGTCACTTGATGTAGAGTTGGGAAA 2665
RP43-172K02 2189 AGACAGTCTCTTGAATAAGTATGAGCTGGTTCCAGCCCACTGCTGAACAC 2238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2666 AGACAGTCTCTTGAATAAGTATGAGCTGGTTCCAGCCCACTGCTGAACAC 2715
RP43-172K02 2239 ATATTTAAAAGCTACAATAGCTCTGCTCACTGCCATTGCAGAGTCTGGAG 2288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2716 ATATTTAAAAGCTACAATAGCTCTGCTCACTGCCATTGCAGAGTCTGGAG 2765
RP43-172K02 2289 GAAAGAGTAGTGGGCTTGATAGGAGTAATTGGCTGGATAATCTTTTGCAA 2338
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2766 GAAAGAGTAGCAGGCTTGATAGGAGCAATTGGCTGAATAATCTTTTGCAA 2815
RP43-172K02 2339 TGCCAATAAATAATGAAAAAGTATATAAATATAATGCTGTATAGAAAGCT 2388
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2816 TGCCAATAAATAATGAAAAAGTATATAAATATAACGCTGTATAGAAAGCT 2865
RP43-172K02 2389 CTCAAGTTCAGTGTTTGGTTAAAATACATACTCAGTAAATGGTAGCTATT 2438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2866 CTCAAGTTCAGTGTTTGGTTAAAATACATACTCAGTAAATGGTAGCTATT 2915
RP43-172K02 2439 ATCGTCTTAGTTTAAGTTATTGCAAGCATTAAAATTAAATGTTTAGCTAC 2488
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2916 ATTGTCTTAGTTTAAGTTATTGCAAGCATTAAAATTAAATGTTTAGCTAC 2965
RP43-172K02 2489 AGACTCAATCCCATTTTAATGTCATTGTGTTAATAAGGCCTCTTAACATT 2538
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2966 AGACTCAATCCAGTTTTAATGTCATTGTGTTAATAAGGCCTCTTAACATT 3015
RP43-172K02 2539 GAAGCAACAAAGATAAAGGAATTTTTTTGTAGCTATTCACGATTCTGCCC 2588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3016 GAAGCAACAAAGATAAAGGAATTTTTTTGTAGCTATTCACGATTCTGCCC 3065
RP43-172K02 2589 AGCTCAAGGTAAAGATAGCAACAAAATACTCCAACCAGAATAAAAGAAGT 2638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3066 AGCTCAAGGTAAAGATAGCAACAAAATACTCCAACCAGAATAAAAGAAGT 3115
RP43-172K02 2639 CTCCACTTGACTGCAGCTCTTCACAACACTTCACAAGGGTCAAGCTGTGT 2688
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3116 CTCCACTTGACTGCAGCTCTTCGCAACACTTCACAAGGGTCAAGCTGTGT 3165
RP43-172K02 2689 TAGTTTCCTTCAGTGTTAAACACAATGCGTCTTAAGAGAATAGTTCAATT 2738
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3166 TAGTTTCCTTCAGTGTTAAACAGAATGCATCTTAAGAGAATAGTTCAATT 3215
RP43-172K02 2739 ATTGATTGAATAGTAGGTTCAAGTTGACTATAATCCCAACGAATACACTC 2788
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3216 ATTGATTGAATAGTAGGTTCAAGTTGACTATAATCCCAACTAATACACTC 3265
RP43-172K02 2789 TAAGACCAGGGATGGGCCGACAGAAGGGTAAAGTTTTCCACTCAAGTCTC 2838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3266 TAAGACCAGGGATGGGCCGACAGAAGGGTAAAGTTTTCCACTCAAGTCTC 3315
RP43-172K02 2839 GAGGCAAACACTCAGATAGAAGTAGTAATATGGATGCCTTCTATTATTTG 2888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3316 GAGGCAAACACTCAGATAGAAGTAGTAATATGGATGCCTTCTATTATTTG 3365
RP43-172K02 2889 GTCACATACAATACTGTTCCAGCCCAGTTGTGCAAAACTGGTGAAATAAA 2938
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3366 GTCA-ATACAATACTGTTCCAGCCCAGTTGTGCAAAACTGGTGAAATAAA 3414
RP43-172K02 2939 AGGCAAAAATATTGACAACAGTTTGGGTAACTGGATTCCAAAATGGGCAT 2988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3415 AGGCAAAAATATTGACAACAGTTTGGGTAACTGGATTCCAAAATGGGCAT 3464
RP43-172K02 2989 CCATCTAAGAG 2999
|||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3465 CCATCTAAGAG 3475
Alignment Score: 2691
Note Best alignment is between forward est and forward genome, and splice sites imply forward gene
Exon 117 100.0 210 326 RP43-172K02 504 620 hsa21-C21orf34_AF486622
Span 117 100.0 210 326 RP43-172K02 504 620 hsa21-C21orf34_AF486622
Segment 117 100.0 210 326 RP43-172K02 504 620 hsa21-C21orf34_AF486622
RP43-172K02 vs hsa21-C21orf34_AF486622:
RP43-172K02 210 AGATGACAAGAGCACCTCAAAGGCAGCAGCCTCAAGGAGCAGCCATGGCC 259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AF486622 504 AGATGACAAGAGCACCTCAAAGGCAGCAGCCTCAAGGAGCAGCCATGGCC 553
RP43-172K02 260 CCAGACTTGTCGCACGGATGCAGAAAACTTAATGGAGGAGGCTGAGGTCA 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AF486622 554 CCAGACTTGTCGCACGGATGCAGAAAACTTAATGGAGGAGGCTGAGGTCA 603
RP43-172K02 310 GAATGGGAAGAGTTTTT 326
|||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AF486622 604 GAATGGGAAGAGTTTTT 620
Alignment Score: 117
Note Best alignment is between forward est and forward genome, and splice sites imply forward gene
Exon 2691 98.2 194 2999 RP43-172K02 678 3475 hsa21-C21orf34_AK095614
Span 2691 98.2 194 2999 RP43-172K02 678 3475 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 3 71.4 194 200 RP43-172K02 678 684 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 3 71.4 201 207 RP43-172K02 686 692 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 1 100.0 209 209 RP43-172K02 693 693 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 832 99.6 211 1048 RP43-172K02 694 1531 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 29 100.0 1050 1078 RP43-172K02 1532 1560 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 1 100.0 1081 1081 RP43-172K02 1561 1561 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 492 98.8 1085 1588 RP43-172K02 1562 2065 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 548 98.6 1589 2152 RP43-172K02 2070 2633 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 1 100.0 2154 2154 RP43-172K02 2634 2634 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 2 100.0 2156 2157 RP43-172K02 2635 2636 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 709 98.4 2160 2892 RP43-172K02 2637 3369 hsa21-C21orf34_AK095614
Segment 106 100.0 2894 2999 RP43-172K02 3370 3475 hsa21-C21orf34_AK095614
RP43-172K02 vs hsa21-C21orf34_AK095614:
RP43-172K02 194 TTCATTC-TCAAACTCTAGATGACAAGAGCACCTCAAAGGCAGCAGCCTC 242
|| || | || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 678 TTTATACATCCAAAT-T-GATGACAAGAGCACCTCAAAGGCAGCAGCCTC 725
RP43-172K02 243 AAGGAGCAGCCATGGCCCCAGACTTGTCGCACGGATGCAGAAAACTTAAT 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 726 AAGGAGCAGCCATGGCCCCAGACTTGTCGCACGGATGCAGAAAACTTAAT 775
RP43-172K02 293 GGAGGAGGCTGAGGTCAGAATGGGAAGAGTTTTTAAAAAATAAAAAGGGG 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 776 GGAGGAGGCTGAGGTCAGAATGGGAAGAGTTTTTAAAAAATAAAAAGGGG 825
RP43-172K02 343 AGCTAATATGTGAGGAACTGATTGCTGCGCATTATTTTCCACTGAACAGA 392
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 826 AGCTAATATGTGAGGAACTGATTGCTGTGCATTATTTTCCACTGAACAGA 875
RP43-172K02 393 CCTTCTTTTAACTTCTAATCTCAAGCACATAGCAGCTGTTGTTTTCATAT 442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 876 CCTTCTTTTAACTTCTAATCTCAAGCACATAGCAGCTGTTGTTTTCATAT 925
RP43-172K02 443 CAAAGATCAGTAAGTGTTTGTTGAATGAATGTATAAATTCTTCCCCAATC 492
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 926 TAAAGATCAGTAAGTGTTTGTTGAATGAATGTATAAATTCTTCCCCAATC 975
RP43-172K02 493 TCTGTTCCATGTAATAAGAACTAAGTTAGCATTCAATTATAAAGAGGACT 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 976 TCTGTTCCATGTAATAAGAACTAAGTTAGCATTCAATTATAAAGAGGACT 1025
RP43-172K02 543 TAGAAAGTCTGCAGACATTTTTGATCAAAAATCCTTTTAACTGTCTTCTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1026 TAGAAAGTCTGCAGACATTTTTGATCAAAAATCCTTTTAACTGTCTTCTT 1075
RP43-172K02 593 ATGGTTCCCGGTAACACCTAAGCCCAAAAAACTCAGGTCATTTCTTGCCT 642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1076 ATGGTTCCCGGTAACACCTAAGCCCAAAAAACTCAGGTCATTTCTTGCCT 1125
RP43-172K02 643 GTACTGTTGCAATAGCCTCATAATAACTAGTCTTCTCCTTTATCAACCAC 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1126 GTACTGTTGCAATAGCCTCATAATAACTAGTCTTCTCCTTTATCAACCAC 1175
RP43-172K02 693 AGTCGTCTCCACTACACAAAGAAGAGAGGGTGCTAATCTAAAGTGTAAAT 742
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1176 AGTCGTCTCCGCTACACAAAGAAGAGAGGGTGCTAATCTAAAGTGTAAAT 1225
RP43-172K02 743 TATTTTAAATCAGCACCCTTCTTGTAATTTCCCAGTGGTTTTTCCTGTCA 792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1226 TATTTTAAATCAGCACCCTTCTTGTAATTTCCCAGTGGTTTTTCCTGTCA 1275
RP43-172K02 793 TAAGAATAACATGCAAAATTCCTTGCTTGCAAAGCCAGGTATGACCTTGC 842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1276 TAAGAATAACATGCAAAATTCCTTGCTTGCAAAGCCAGGTATGACCTTGC 1325
RP43-172K02 843 CCCGTCTACCTTACTGGCATCGTCTCTCATGACTCTTCCCCTTTTTCACT 892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1326 CCCGTCTACCTTACTGGCATCGTCTCTCATGACTCTTCCCCTTTTTCACT 1375
RP43-172K02 893 CTCCATCTTGCCTTTTCCCAACCATGCCTGCTAGTGAGCCTTAGCCCTTG 942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1376 CTCCATCTTGCCTTTTCCCAACCATGCCTGCTAGTGAGCCTTAGCCCTTG 1425
RP43-172K02 943 TGTTTTCTCTGCCAGGGATGCATGACTGGCTTCTTTACTTTATTCTGATC 992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1426 TGTTTTCTCTGCCAGGGATGCATGACTGGCTTCTTTACTTTATTCTGATC 1475
RP43-172K02 993 TCTCTGCTCAAATGTCATCTTTTTAGAGATAGCTTTCCTAAACATCTTTA 1042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1476 TCTCTGCTCAAATGTCATCTTTTTAGAGATAGCTTTCCTAAACATCTTTA 1525
RP43-172K02 1043 AAAGTACCCCCATGAACTGTGAAACACCTTTCCTGCTTTAAGTTTTCTTC 1092
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1526 AAAGTA-CCCCATGAACTGTGAAACACCTTTCCTGC--T---TTTTCTTC 1569
RP43-172K02 1093 ATAGTACTTATCACTTCCTGATATTATGTTAGACAACAAGCAAATAAGTA 1142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1570 ATAGTACTTATCACTTCCTGATATTATGTTAGACAACAAGCAAATAAGTA 1619
RP43-172K02 1143 TATGCTGTTCCCACTAAAATATAAGCTCCATTTGAACAGGAGCCTTGATT 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1620 TATGCTGTTCCCACTAAAATATAAGCTCCATTTGAACAGGAGCCTTGATT 1669
RP43-172K02 1193 ATTCCTGAGTATACCCCTAGTGCCCAGAACCTAGTAGGACTTTAATAAAT 1242
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1670 ATTCCTGAGTATACCCCTAGTGCCCAGAACCTAGTAGGGCTTTAATAAAT 1719
RP43-172K02 1243 ATTAGATTCATTTGTTGAATGAAAAAATGAATGAATAATTGAATAAAGAT 1292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1720 ATTAGATTCATTTGTTGAATGAAAAAATGAATGAATAATTGAATAAAGAT 1769
RP43-172K02 1293 ATCCAGGTAGAGTGTCCGGGCAGCCCAACCTATGTGAAGCCAGTACAAGA 1342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1770 ATCCAGGTAGAGTGTCCGGGCAGCCCAACCTATGTGAAGCCAGTACAAGA 1819
RP43-172K02 1343 ATGTATCTGTGACATAGTGAATGCAATTATTCCTCCAAATGATGAACTTG 1392
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1820 ATGTTTCTGTGACATAGTGAGCGCAATTATTCCTCTAAATGATGAACTTG 1869
RP43-172K02 1393 CATGAGTACACAAGGATAAAATTAAGCACGTAGTTTAGATTTCTGCAAGT 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1870 CATGAGTACACAAGGATAAAATTAAGCACGTAGTTTAGATTTCTGCAAGT 1919
RP43-172K02 1443 CTCTTCCTCAGATTGAGGAAAAACAAAGAAATTGAGCTTATTCTCACCTC 1492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1920 CTCTTCCTCAGATTGAGGAAAAACAAAGAAATTGAGCTTATTCTCACCTC 1969
RP43-172K02 1493 ATTCTTACATGAACTAAATCCAGAATAAAGCATCATTTATATACCAAGCA 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 1970 ATTCTTACATGAACTAAATCCAGAATAAAGCATCATTTAAATACCAAGCA 2019
RP43-172K02 1543 CATCCCTACCTCAGCCACTCATGGAATACTTTATCTGTAAAGGGAC---- 1589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2020 CATCCCTACCTCAGCCACTCATGGAATACTTTATCTGTAAAGGGACAGAT 2069
RP43-172K02 1589 AGATAGTAAATATTTTTGGCTTTGGGGACCGTAGAGTCTGTGTCCCCGCT 1638
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||
hsa21-C21orf34_AK095614 2070 AGATAGTAAATATTTTTGGCTTTGGGGACCGTACAGTCTGTGTCGCCACT 2119
RP43-172K02 1639 ACTCAGCACTTCTGTTGAGGTGTGGAATCAGCCCTAGACAACACAGAAAC 1688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2120 ACTCAGCACTTCTGTTGAGGTGTGGAATCAGCCCTAGACAACACATAAAC 2169
RP43-172K02 1689 AAATGGGTGTGGCTGTGTTCCAATCAAATGTTATTTATAAAACTAGGAAA 1738
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2170 AAATGGGTGTGGCTGTGTTCCAATAAAATGTTATTTATAAAACTAGGAAA 2219
RP43-172K02 1739 TCAGCAGATTTAGTCCACAGGCTGTAGTTTGCTGACCCTTGAATTAGAGA 1788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2220 TCAGCAGATTTAGTCCACAGGCTGTAGTTTGCTGACCCTTGAATTAGAGA 2269
RP43-172K02 1789 GTCTTCCCCAAATCCTCTTCCCAAGTTATTGAAAGAATGCCCATAGGACC 1838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2270 GTCTTCCCCAAATCCTCTTCCCAAGTTATTGAAAGAATGCCCATAGGACC 2319
RP43-172K02 1839 ATAGCTCCCTCACCTGGTTCTTTCAAGAAATGAGACAAATTCAGGGATGG 1888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2320 ATAGCTCCCTCACCTGGTTCTTTCAAGAAATGAGACAAATTCAGGGATGG 2369
RP43-172K02 1889 TTGGAGGGTGGAACGCCTACCTGTGACATGACTATTGAGCCTGATTTCTT 1938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2370 TTGGAGGGTGGAACGCCTACCTGTGACATGACTATTGAGCCTGATTTCTT 2419
RP43-172K02 1939 TCCTTTTATCTCTTTAAAGTGAGTCAGGTCTTAACTTTAAACTGTCTCTA 1988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2420 TCCTTTTATCTCTTTAAAGTGAGTCAGGTCTTAACTTTAAACTGTCTCTA 2469
RP43-172K02 1989 AAGTGGCAATAACTGGGCCATGTCAAATACTCCCAATGACAAAATTTCTT 2038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2470 AAGTGGCAATAACTGGGCCATGTCAAATACTCCCAATGACAAAATTTCTT 2519
RP43-172K02 2039 CTTGGAGAATGAATGGGGGTTGCATACAGTGGTGTGTTGGTAAATGTTTA 2088
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2520 CTTGGAGAATGAATGAGGGTTGCATACAGTGGTGTGTTGGTAAATGTTTA 2569
RP43-172K02 2089 GCAACTGGCTCTCTTACTGATTTCCGTAGTGTAAATTCTGCCATCCTGGC 2138
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2570 GCAACTGGCTCTCTTACTGATTTCTGTAGTGTAAATTCTCCCATCCTGGC 2619
RP43-172K02 2139 CATCTGAAACTACCAATATGAATGATGTCACTTGATGTAGAGTTGGGAAA 2188
|||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2620 CATCTGAAACTACC-A-AT--ATGATGTCACTTGATGTAGAGTTGGGAAA 2665
RP43-172K02 2189 AGACAGTCTCTTGAATAAGTATGAGCTGGTTCCAGCCCACTGCTGAACAC 2238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2666 AGACAGTCTCTTGAATAAGTATGAGCTGGTTCCAGCCCACTGCTGAACAC 2715
RP43-172K02 2239 ATATTTAAAAGCTACAATAGCTCTGCTCACTGCCATTGCAGAGTCTGGAG 2288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2716 ATATTTAAAAGCTACAATAGCTCTGCTCACTGCCATTGCAGAGTCTGGAG 2765
RP43-172K02 2289 GAAAGAGTAGTGGGCTTGATAGGAGTAATTGGCTGGATAATCTTTTGCAA 2338
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2766 GAAAGAGTAGCAGGCTTGATAGGAGCAATTGGCTGAATAATCTTTTGCAA 2815
RP43-172K02 2339 TGCCAATAAATAATGAAAAAGTATATAAATATAATGCTGTATAGAAAGCT 2388
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2816 TGCCAATAAATAATGAAAAAGTATATAAATATAACGCTGTATAGAAAGCT 2865
RP43-172K02 2389 CTCAAGTTCAGTGTTTGGTTAAAATACATACTCAGTAAATGGTAGCTATT 2438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2866 CTCAAGTTCAGTGTTTGGTTAAAATACATACTCAGTAAATGGTAGCTATT 2915
RP43-172K02 2439 ATCGTCTTAGTTTAAGTTATTGCAAGCATTAAAATTAAATGTTTAGCTAC 2488
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2916 ATTGTCTTAGTTTAAGTTATTGCAAGCATTAAAATTAAATGTTTAGCTAC 2965
RP43-172K02 2489 AGACTCAATCCCATTTTAATGTCATTGTGTTAATAAGGCCTCTTAACATT 2538
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 2966 AGACTCAATCCAGTTTTAATGTCATTGTGTTAATAAGGCCTCTTAACATT 3015
RP43-172K02 2539 GAAGCAACAAAGATAAAGGAATTTTTTTGTAGCTATTCACGATTCTGCCC 2588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3016 GAAGCAACAAAGATAAAGGAATTTTTTTGTAGCTATTCACGATTCTGCCC 3065
RP43-172K02 2589 AGCTCAAGGTAAAGATAGCAACAAAATACTCCAACCAGAATAAAAGAAGT 2638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3066 AGCTCAAGGTAAAGATAGCAACAAAATACTCCAACCAGAATAAAAGAAGT 3115
RP43-172K02 2639 CTCCACTTGACTGCAGCTCTTCACAACACTTCACAAGGGTCAAGCTGTGT 2688
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3116 CTCCACTTGACTGCAGCTCTTCGCAACACTTCACAAGGGTCAAGCTGTGT 3165
RP43-172K02 2689 TAGTTTCCTTCAGTGTTAAACACAATGCGTCTTAAGAGAATAGTTCAATT 2738
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3166 TAGTTTCCTTCAGTGTTAAACAGAATGCATCTTAAGAGAATAGTTCAATT 3215
RP43-172K02 2739 ATTGATTGAATAGTAGGTTCAAGTTGACTATAATCCCAACGAATACACTC 2788
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3216 ATTGATTGAATAGTAGGTTCAAGTTGACTATAATCCCAACTAATACACTC 3265
RP43-172K02 2789 TAAGACCAGGGATGGGCCGACAGAAGGGTAAAGTTTTCCACTCAAGTCTC 2838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3266 TAAGACCAGGGATGGGCCGACAGAAGGGTAAAGTTTTCCACTCAAGTCTC 3315
RP43-172K02 2839 GAGGCAAACACTCAGATAGAAGTAGTAATATGGATGCCTTCTATTATTTG 2888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3316 GAGGCAAACACTCAGATAGAAGTAGTAATATGGATGCCTTCTATTATTTG 3365
RP43-172K02 2889 GTCACATACAATACTGTTCCAGCCCAGTTGTGCAAAACTGGTGAAATAAA 2938
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3366 GTCA-ATACAATACTGTTCCAGCCCAGTTGTGCAAAACTGGTGAAATAAA 3414
RP43-172K02 2939 AGGCAAAAATATTGACAACAGTTTGGGTAACTGGATTCCAAAATGGGCAT 2988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3415 AGGCAAAAATATTGACAACAGTTTGGGTAACTGGATTCCAAAATGGGCAT 3464
RP43-172K02 2989 CCATCTAAGAG 2999
|||||||||||
hsa21-C21orf34_AK095614 3465 CCATCTAAGAG 3475
Alignment Score: 2691
