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Des rayons de soleil descendent dans une mangrove ombragée au milieu d'une région tropicale équatoriale, peut-être le centre de la biodiversité marine.Crédit: Velvetfish/iStock/Getty Images Plus

La perte de biodiversité continue de s'aggraver à un rythme sans précédent en Afrique. Si la sous-représentation du continent dans le paysage mondial de la génomique est bien documentée, une nouvelle initiative espère combler cette lacune et sauvegarder la biodiversité du continent. Le projet s'appuiera sur les ressources génomiques pour aider les sélectionneurs et les conservationnistes du continent.Le projet, dont le coût s'élève à un milliard de dollars, a été présenté à Nature Africa par ses défenseurs, qui affirment que ses avantages en valent la peine.

Dans un commentaire publié dans Nature en mars 2022, ThankGod Echezona Ebenezer et ses collègues ont défendu l'importance du projet African BioGenome (AfricaBP), une initiative de génomique axée sur l'Afrique et dirigée par elle, qui pourrait fournir des informations pertinentes sur la biodiversité en Afrique.

Une base de données génomiques

L'objectif d'AfricaBP est de créer une base de données génomiques de référence en Afrique et pour l'Afrique. Il vise à séquencer les génomes de 105 000 espèces endémiques : plantes, animaux, champignons, protistes et autres eucaryotes. Il déclare impliquer 109 scientifiques africains (dont 87 travaillent en Afrique) et 22 organisations africaines.

En plus d’informations pour une conservation de la biodiversité à l'échelle de l’Afrique,il y a également des implications pour des systèmes alimentaires résilients et durables,

Au-delà de la projection de l'Afrique en tant que région abritant des espèces endémique , l'initiative estime également que le continent a des contributions à apporter concernant les pratiques et les mesures de conservation soutenant et sauvegardant la biodiversité.

"Il est nécessaire que les communautés infusent leurs connaissances culturelles dans les pratiques génomiques, ce qui contribuera à améliorer le processus de conservation", a déclaré M. Ebenezer.

Les tâches à accomplir

Même s'il vise à remédier à la pénurie d'informations génomiques en provenance d'Afrique, le projet ne se déroule pas sans heurts. De nombreux obstacles se dressent lorsqu'il s'agit de la propriété des gouvernements africains et des régulateurs nationaux. Par exemple, l'AfricaBP a organisé le mois dernier un forum au cours duquel des représentants du gouvernement du Malawi ont discuté avec les intervenants des avantages et des problèmes potentiels liés aux brevets dans le pays.

Mais M. Ebenezer estime que ces conversations sont normales et attendues, étant donné que des protocoles sont nécessaires pour faciliter les efforts transfrontaliers qui assureront le succès du projet. "Il ne suffit pas de prélever des échantillons dans un pays comme le Malawi et de laisser la population sans rien", a-t-il déclaré.

Les chercheurs à l'origine du projet veulent séquencer 2 500 espèces africaines indigènes, dont le serpent aveugle à bec de Boyle (Rhinotyphlops boylei) d'Afrique australe et le palétuvier rouge (Rhizophora mangle) du Nigeria. Mais pour atteindre ses objectifs dans les dix ans prévus, le projet doit être rapidement étendu, ce qui nécessitera un budget annuel de 100 millions de dollars. Ses dirigeants espèrent attirer des bailleurs de fonds à l'intérieur et à l'extérieur de l'Afrique, tels que la Commission de l'Union africaine, l'Académie Africaine des Sciences et la National Science Foundation des États-Unis.

Il a toutefois admis que l'obtention des fonds pourrait être une bataille difficile compte tenu de la priorité accordée à la lutte contre les maladies infectieuses et de plusieurs autres intérêts et engagements concurrents des potentiels bailleurs de fonds.